尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒(HPV)引起的局部皮肤感染所致，不经血流扩散。但是尖锐湿疣主要是由不洁性交所传染，所以在传染过程中，除了会感染到人乳头瘤病毒外，还有可能会同时传染上梅毒螺旋体或艾滋病病毒，由于每个人抵抗力的不同，有些人感染了梅毒螺旋体或艾滋病病毒后，并没有明显的临床症状出现，需要抽血筛选，非梅毒螺旋体抗原血清试验，如快速血浆反应素环状卡片试验(RPR检查)梅毒血清试验和人类免疫缺陷病毒抗体，以排除梅毒与艾滋病。此外。在发现二期梅毒时，外阴、肛周出现的扁平湿疣，本身就容易与尖锐湿疣混淆，更需要通过血清检查来区分。

有些病人在感染人乳头瘤病毒的同时，还可能同时感染其他性病，如淋病、非淋菌性尿道炎、宫颈炎或其他念珠菌、滴虫等阴道炎，甚至多种病原体混合感染。所以，所有的病人都应配合医生做好其他方面的病原体检查，以排除其他感染，特别是女性病人，一旦其他感染造成白带增多，外阴充血水肿，阴部环境潮湿加剧，更有利于尖锐湿疣的生长，不利于治疗，也增加了复发的机会。因此，女性病人更应注意白带的全面检查，发现疾病，及时治疗，有助于尖锐湿疣的早目治疗。