在临床上西药治疗尖锐湿疣复发是一个普遍的现象，但尖锐湿疣复发却有两种明显不同的情况。一种是一些患者复发只在2～3次，随后就终生不再复发(除非再次感染)。而有的患者(只占复发患者中的少数)却面临着十分频繁的复发，这些患者复发可达五、六次，多的复发达二十几次，临床上这些患者的治疗起来往往十分棘手。这些人当中由于存在糖尿病、肝炎或其它免疫力低下的情况，往往要进行综合方面的治疗才能见效，治疗费用也昂贵，尤其是要注射增强免疫的药物。好在这种严重的复发情况并不多见，对于绝大多数的患者是不会出现这种情况的，因此患者不必对此过于忧虑。
对于多数的患者，经过科学治疗，其中一部分人即使会复发，也不过只有2～3次而已。当然有的患者对于这2～3次复发也会有恐惧心理，这可能是由于激光治疗太过痛苦的缘故。因为去除疣体的过程是比较温和的，甚至有的患者不知不觉中疣体就脱落了，所以对于治疗过程没有恐惧的感受。对于严重的反复复发的患者，建议要配合其它药物。这是因为这些患者要经历多次去除疣体的过程，如果每次都用激光，可能会对生殖器造成长久的伤害。
