在治疗方面，对于尖锐湿疣外用药物的选择，如阿昔洛韦软膏、无环鸟苷乳膏、更昔洛韦乳膏或者啫喱膏、泛昔洛韦凝胶、咪奎莫特乳膏、重组人a-2b干扰素凝胶或乳膏等剂型，并需加强外生殖器部位的清洁。必须要说明的是，尖锐湿疣的治疗首选物理性措施，外用的药膏包括各种抗病毒乳膏，只能作为辅助治疗，不能作为根本的治疗方法。尖锐湿疣物理治疗最常使用的是液氮冷冻，或者是采取电离子激光，以尽可能地去除肉眼可视的疣体。如果患者有条件（对待特殊部位，如位于尿道口或宫颈、肛周等处），最好是能够接着做光动力治疗（简称PDT）。